Ścieki szpitalne znacząco różnią się od typowych ścieków bytowo-komunalnych zarówno pod względem składu chemicznego, jak i poziomu zagrożenia biologicznego. Powstają one w różnorodnych jednostkach ochrony zdrowia i placówkach medycznych, takich jak szpitale, kliniki, laboratoria diagnostyczne, oddziały zakaźne, stacje krwiodawstwa czy zakłady medycyny nuklearnej.